สำนักคอมพิวเตอร์ได้รับการจัดตั้งขึ้น เมื่อวันที่ 16 กันยายน 2539 ตามแผนพัฒนาการศึกษา ระดับอุดมศึกษา ระยะที่ 8 (พ.ศ.2540-2544) เดิมมีชื่อเต็มว่า สำนักคอมพิวเตอร์และเทคโนโลยีสารสนเทศ โดยมีการจัดแบ่งส่วนงานภายในเป็นฝ่ายต่าง ๆ ดังนี้   

ฝ่ายเลขานุการ ฝ่ายวิชาการและฝึกอบรม ฝ่ายระบบงานคอมพิวเตอร์ ฝ่ายควบคุมระบบเครื่องคอมพิวเตอร์

       โดยมีคณะกรรมการสำนักคอมพิวเตอร์ฯ ควบคุมดูแลการบริหารงาน มหาวิทยาลัยได้แต่งตั้งให้นายประยุทธ สุระเสนา รักษาการในตำแหน่งผู้อำนวยการสำนักคอมพิวเตอร์เป็นคนแรก จากนั้นสำนักคอมพิวเตอร์ฯ ได้เข้ามารับผิดชอบงานที่เกี่ยวข้องกับการนำเทคโนโลยีสารสนเทศเข้ามาใช้เพื่อการบริหารและการจัดการศึกษา ซึ่งมีโครงการที่สำคัญ ดังนี้

       ต้น 2540 เริ่มเปิดให้บริการคอมพิวเตอร์ รวมถึงการจัดอบรมสัมนา
      ปลายปี 2540 เปิดให้บริการคอมพิวเตอร์และอินเตอร์เน็ต
      ต้นปี 2541 โครงการ Campus Network วางระบบเครือข่ายภายในทั้งมหาวิทยาลัย

       ต่อมาได้มีการปรับเปลี่ยนคณะกรรมการการบริหารชุดใหม่ โดยมีนายวิมาน ใจดี และนายณรงค์ ทองอิสาณ รักษาการในตำแหน่งผู้อำนวยการสำนักคอมพิวเตอร์ฯในปี2542 ตามลำดับ